Johns Hopkins Kimmel癌癥中心的研究人員已使用深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),將重要的見(jiàn)解(描述性和描述性)引入對(duì)來(lái)自大量T細(xì)胞受體測(cè)序數(shù)據(jù)的適應(yīng)性免疫中。
該團(tuán)隊(duì)將這項(xiàng)技術(shù)作為開(kāi)源軟件進(jìn)行展示。他們的目的是幫助正在努力了解免疫系統(tǒng)對(duì)癌癥,傳染病,自身免疫狀況或T細(xì)胞受體有助于抵抗的任何其他疾病的臨床研究人員?!蹲匀煌ㄓ崱芬呀?jīng)發(fā)表了該研究報(bào)告。
“隨著基于測(cè)序的技術(shù)變得越來(lái)越普遍,本文中介紹的算法等將在識(shí)別和表征相關(guān)生物信號(hào)方面找到更多的實(shí)用工具,從而使人們對(duì)隱藏在大量數(shù)據(jù)中的復(fù)雜基因組概念有了新的認(rèn)識(shí),” MD寫(xiě)道。 / PhD候選人John-William Sidhom及其同事。
T細(xì)胞受體或TCR是釋放白細(xì)胞以對(duì)抗并試圖殺死感染的,外來(lái)的和癌細(xì)胞的免疫系統(tǒng)成分。
作者將其開(kāi)源軟件包DeepTCR告訴Johns Hopkins的新聞部門(mén),該軟件使用了監(jiān)督和無(wú)監(jiān)督的深度學(xué)習(xí)。
約翰·霍普金斯(Johns Hopkins)在新聞中解釋說(shuō),無(wú)監(jiān)督方法“允許研究人員以探索性的方式分析其數(shù)據(jù),而可能沒(méi)有已知的免疫暴露,而無(wú)監(jiān)督方法將允許研究人員利用已知的暴露量來(lái)改善模型的學(xué)習(xí)。”放開(kāi)。
“結(jié)果是……DeepTCR將使研究人員能夠通過(guò)識(shí)別賦予T細(xì)胞識(shí)別和殺死病理細(xì)胞功能的受體模式,從而在基礎(chǔ)和臨床科學(xué)中研究T細(xì)胞免疫反應(yīng)的功能。”