澳大利亞研究人員開發(fā)了一種技術，用于發(fā)現(xiàn)罕見的免疫細胞，這些細胞可以從患者自身的免疫系統(tǒng)中對癌細胞產(chǎn)生反應。

他們將其比作條形碼跟蹤器，能夠一次掃描數(shù)千個免疫細胞的詳細信息。

“這種方法為我們提供了關于免疫細胞在人體中如何表現(xiàn)的最詳細的觀點，”Garvan醫(yī)學研究所的資深作者Chris Goodnow說。

“免疫細胞在疾病的發(fā)展中起著關鍵作用。這種方法顯示出巨大的潛力，可以幫助我們個性化癌癥治療個體。“

這項新技術 - 被稱為RAGE-seq-- 在Nature Communications 雜志的一篇論文中有所描述。它由Garvan免疫基因組學實驗室的Mandeep Singh和腫瘤進展實驗室的Ghamdan Al-Eryani開發(fā)。

以前的方法已經(jīng)能夠讀取從單個細胞中編碼免疫細胞受體的長鏈遺傳輸出(RNA)，但研究人員說，它沒有成功地分析腫瘤中存在的數(shù)千個細胞。時間。

他們的方法 - 通過測序的保留曲目和基因表達，使其全名 - 是通過協(xié)調(diào)四種不同的基因組技術而開發(fā)的。

他們首先開發(fā)了一種從單細胞中富集RNA的方法，靶向編碼免疫細胞受體的RNA，然后開發(fā)了一種計算工具來準確讀取免疫細胞受體的全長序列。

通過一次“掃描”數(shù)千個細胞中的相關免疫細胞受體，RAGE-seq可以提供組織樣本中免疫細胞如何相關的準確快照，以及哪些細胞可以有效地產(chǎn)生針對癌癥的反應。

在一項原理驗證研究中，研究人員使用該方法從乳腺癌患者的腫瘤和相關淋巴結(jié)中采集7138細胞。

他們確定了兩種組織中存在的許多相關細胞，并揭示了患者腫瘤內(nèi)免疫反應的特定遺傳特征。

他們現(xiàn)在將該技術應用于黑素瘤患者的樣本，以了解為什么接受免疫治療的患者中有一半的反應較差。他們認為同樣的方法也可以用于自身免疫和炎癥性疾病。